Der in Kempten (Allgäu) geborene Dirigent Daniel Johannes Mayr studierte an der Hochschule für Musik Würzburg Schulmusik und Dirigieren bei Prof. Hans Rainer Förster und Prof. Peter Falk. Er war Lehrbeauftragter an der Opernschule in Würzburg sowie Korrepetitor am Mainfranken Theater. Des Weiteren hatte er Lehraufträge an der Hochschule für Künste in Bremen und an der Hochschule für Musik Detmold inne und dirigierte dort Konzertprojekte mit dem Hochschulorchester.
Seit dem Wintersemester 2025/2026 hat Daniel Johannes Mayr die die Professur für die musikalische Leitung der Opernschule an der Hochschule für Musik und Theater München inne.
Nach ersten Festengagements an der Komischen Oper Berlin als stellvertretender Chordirektor unter GMD Kirill Petrenko, als Chordirektor und Kapellmeister am Theater Nordhausen und in gleicher Funktion am Theater Bremen, kam Daniel Johannes Mayr an die Oper Bonn. Er arbeitete von 2010 bis 2013 als musikalischer Assistent des Chordirektors Eberhard Friedrich bei den Bayreuther Festspielen und ist dem Akademischen Orchester Bonn als Dirigent verbunden.
Daniel Johannes Mayr ist seit der Spielzeit 2017/18 am Theater Bonn als Erster Koordinierter Kapellmeister engagiert und hat seit der Spielzeit 2025/26, neben seiner halben Professur an der HMTM, die Position des 1. Kapellmeisters inne.
Eine Herzensangelegenheit ist Daniel Johannes Mayr die Musikvermittlung an Kinder und Jugendliche. So leitet und moderiert er neben den Familienopern viele Familien- und Kinderkonzerte mit dem Beethoven Orchester Bonn.