Stephan Zippe ist seit 2006 Professor für Gregorianik und deutschen Liturgiegesang an der Hochschule für Musik und Theater München und seit 2019 Diözesanmusikdirektor des Erzbistums München und Freising. Das Studium der katholischen Kirchenmusik hat er von 1992 bis 1997 mit einem Schwerpunkt im Fach Gregorianischer Choral bei Johannes B. Göschl absolviert.
Er ist langjähriges Mitglied der Internationalen Studiengesellschaft für Gregorianischen Choral (AISCGre), Mitglied im Arbeitskreis Melodierestitution der AISCGre, dessen Leiter er seit 2023 ist, sowie seit 2011 erster Vorsitzender der deutschsprachigen Sektion der AISCGre. Er ist außerdem Mitherausgeber der Beiträge zur Gregorianik, des Graduale Novum (2011/2018) und des neuen Münchener Kantorale (2013–2023).