Andrea Lieberknecht war von 1989 bis 1991 Soloflötistin im Rundfunkorchester des Bayerischen Rundfunks und von 1991 bis 2002 im Sinfonieorchester des Westdeutschen Rundfunks Köln. Neben ihrer Orchestertätigkeit war sie Dozentin an den Hochschulen für Musik in Köln und Hannover. 2002 übernahm sie die ordentliche Professur für Flöte an der Hochschule für Musik, Medien und Theater Hannover. Seit dem Studienjahr 2011/12 ist sie Professorin für Flöte an der Hochschule für Musik und Theater München.