Sayaka Matsunaga begann im Alter von sieben Jahren mit dem Klavierspiel. Bereits in ihrer Jugend entdeckte sie ihre Leidenschaft für das Cembalo und erhielt ab dem 16. Lebensjahr entsprechenden Unterricht. Nach dem Abitur wurde sie in die Klasse von Prof. Naoya Otsuka an der Tokyo University of the Arts aufgenommen. Seit 2018 setzte sie ihre Studien an der Hochschule für Musik und Theater München bei Prof. Christine Schornsheim fort. Ihr Bachelor- sowie ihr Masterstudium schloss sie mit den besten Ergebnissen ab. Im Anschluss daran vertiefte sie ihre Ausbildung am Hammerklavier, ebenfalls bei Prof. Schornsheim.
Sayaka Matsunaga ist regelmäßig als Solistin, Kammermusikerin sowie in verschiedenen Ensembles und Orchestern zu hören. Darüber hinaus ist sie als Korrepetitorin tätig. Ihr Interesse an Musikpädagogik verwirklicht sie in ihrer Unterrichtstätigkeit für Klavier und Cembalo. Derzeit ist sie als Cembalokorrepetitorin an der Hochschule für Musik und Theater München tätig.